心胸外科是医院的重点发展学科，由专家门诊，病房，监护室，体外循环室（筹建中）组成。专家团队分别在北京阜外心血管医院、中山大学第一附属医院、深圳孙逸仙心血管医院、天津肿瘤医院等进修学习。
心胸外科目前有医师4人，其中主任医师1人，副主任医师1人，主治医师1人，住院医师1人。其中博士1人，硕士1人。
学科高新设备齐全，包括全套进口体外循环机、变温水箱、一体高清胸腔镜系统、纤维支气管镜、肺功能检测仪、血气分析仪等；配有进口切割吻合器械、冠状动脉搭桥器械、手术放大镜、手术头灯等。
学科技术全面、特色明显，能熟练开展三级医院各项手术，包括低温体外循环心内直视手术、部分先心病矫治手术，冠脉搭桥术、心脏单瓣或多瓣膜置换术、食道癌、肺癌手术、纵隔手术，支气管、肺动脉成形术等高难度手术及胸部微创手术等，对于胸部肿瘤有一整套成熟完善的治疗方案，心胸外科率先在全市开展胸腔镜下手汗症微创手术。同时可以开展肿瘤血管介入相关的多种手术：胸腹主动脉瘤及夹层腔内支架隔绝术、下肢静脉栓塞取栓及溶栓治疗、下腔静脉滤器置入术、各种肿瘤血管栓塞化疗治疗、消化道及呼吸道出血的栓塞治疗等。